丽水市区域内有瓯江、钱塘江、飞云江、灵江、闽江、交溪水系，与山脉走向平行。仙霞岭是瓯江水系与钱塘江水系的分水岭，洞宫山是瓯江水系与闽江、飞云江和交溪的分水岭，括苍山是瓯江水系与灵江水系的分水岭。两岸地形陡峻，江、溪源短流急，河床割切较深，水位暴涨暴落，属山溪性河流。瓯江发源于庆元县、龙泉市交界的洞宫山锅帽尖西北麓，自西向东蜿蜒过境，干流长388千米，境内长316千米，流域面积12985.47平方千米，占全市总面积78%，是全市第一大江。位于瓯江上游龙泉溪的紧水滩电站水库即仙宫湖，面积34.3平方千米，是全市最大的人工湖泊。