有机高分子絮凝剂由于分子上的链节与水中胶体微粒有极强的吸附作用，絮凝效果优异。同无机高分子絮凝剂相比，有机高分子具有用量少、絮凝速度快、受共存盐和pH值及温度影响小、生成污泥量少且易于处理等优点。有机高分子絮凝剂的加入量具有一个最佳值，浓度过高时胶体的颗粒表面吸附了大量的高分子物质，就会在表面形成空间保护层，阻止了架桥结构的形成，反而比较稳定使得絮凝不易发生。同时絮凝剂也存在一个最佳离解度，高分子电解质的离解程度越大，电荷密度越高，分子就越扩展这有利于架桥；但另一方面倘若高分子电解质的带电符号与微粒相同，则高分子带电越多，越不利于它在微粒上的吸附，就越不利于架桥。一般用阳离子型聚丙烯酰胺(PAM)，但由于PAM价格昂贵，且其单体有毒，工业一般将PAM与无机絮凝剂复配使用。选用PAM作助凝剂可能会在排水或排泥中带入二次污染，所以近年来有人提出用超细滑石粉(SFT)替代PAM助凝。