华大基因拉开大规模测序的序幕


转自:华大基因网     

    来源:nature biotechnology 作者:John Fox/Jim Kling  

中国华大基因研究院已经成为世界上最大的新一代测序中心,拥有128Illumina公司生产的Hiseq2000测序仪。华大基因利用自身高性能测序平台,开展大量科技合作,并且在国际顶尖学术杂志上发表了一系列高水平论文。
 
2010年,新仪器将陆续被安置在香港科技园中。华大基因执行总裁王俊先生表示,“华大基因努力构建研究和应用平台,致力于中国农业、生物能源、个体化健康医疗等领域的可持续发展”。华大基因香港研发中心的成立也将为香港的生物技术领域带来巨大突破。香港中文大学李嘉诚健康科学研究所所长 Dennis Lo 认为:“华大基因香港研发中心拥有世界第一的DNA测序设备,吸引着大量基因组学和生物信息学的人才,从而促进其与当地研究机构的合作。”他进一步表示,华大香港中心具有高度的国际视角,足以吸引香港政府和商业部门增加对生物技术产业的投资。
 
华大基因副总裁张秀清女士透露了一份周密的国际计划,华大基因购入的仪器将服务于全球的科学家们,每运行一次可以产生20亿双末端读写和200GB的高质量数据,并可对2个人类基因组进行30倍深度覆盖率的测序。张女士指出,华大基因的目标是在全世界范围内建立合作关系,促进整个社会的进步,包括有效提高农作物的产量及重点开发个人基因组领域。
 
专注于全基因组研究的Sequenom公司首席科学主管 Charles Cantor 表示,华大基因对新仪器的投资有利于降低医疗费用,促进动植物产业发展。他十分看好中国市场,并认为中国已开发拥有世界领先的基因组分析软件。
 
华大基因已建成大规模测序平台,拥有高效的生物信息分析和创新的基因健康医疗诊断技术,将有效地带动中国基因组事业的全面发展。华大基因执行总裁兼丹麦哥本哈根大学教授王俊先生表示,华大基因的测序平台服务于世界性的合作项目,例如:1亿美金启动千种动植物参考基因组计划,万种微生物基因组计划以及中国癌症基因组计划。
 
纵观基因组学发展历史,华大基因从参与1%人类基因组计划,到10%人类单体型图计划,中英家鸡计划,水稻基因组全测序,蚕基因组计划和炎黄一号。这些项目确立了华大基因领先世界测序领域的地位。
 
王俊继续表示,尽管现在主要物种的参考基因组很常见,但是许多物种变异体的特异性有待进一步研究,外显子、宏基因组、表观基因组和转录组领域值得大规模的深入研究。
 
在应用方面,港中大李嘉诚健康科学研究所所长Dennis Lo带领的团队率先将新一代测序技术作为分子诊断工具,比如非侵入式产前诊断。港中大的研究员们正在对病毒和细菌进行测序工作。
 
王俊先生继续表示,中国的基因组学研究正在获得越来越多的国际合作所带来的宝贵资源,华大基因需要更多有志青年的加入,参与数据分析工作。最后,王俊先生强调,尽管华大基因是世界上第一大测序平台,但是基因组学工作必须依靠国际间的紧密合作来完成。
 
千人基因组计划是一个成功的案例。在该项目中,华大基因与德国,英国和美国的基因组中心合作完成了拥有不同种族背景的1千个人的人体基因变异检测。
 
中国人口数目巨大,这对研究基因组变异和疾病的关系提供了极好的样本条件。中国已宣布展开癌症研究工作。澳大利亚墨尔本大学的基因组研究中心负责人Richard Cotton认为,通过解读病人的样本,这项研究最终能有效改善中国人群的健康医疗水平。Cotton表示,在中国,病人们可以被分类以获取大量的样本信息。
 
Sequenom公司首席科学主管 Charles Cantor认为随着测序和分析技术的不断加强,中国有望成为拥有最多生物科学家的国家。伴随着这种良好的发展态势,中国的科技研究水平将稳步上升。中国的基因组研究中心在投资和科学成果方面,已经可以与欧美的一流机构媲美,即使目前各国际机构之间的合作多于竞争关系。
 
“中国在基因组学研究的努力将带动其他产业的飞速发展,这一点值得其他各国借鉴。我认为中国人做得很棒。因为有华大基因这样优秀的团队,他们所创造的成就非常了不起。如果其他国家,像美国或者英国建立自己的基因组测序平台将是一件好事,而且越多越好。”美国华盛顿大学医学院基因组中心负责人Richard Wilson 如是评价道