由于农业农村经济发展基础差，发展的质量总体还不高，受市场影响较大，发展中仍遇到许多困难和问题。主要有五个方面：

　　一是促进农民收入较快增长的难度仍较大。2006年农民增收、粮食增产主要得益气候对农业生产十分有利，甘蔗、茶叶、橡胶、牛肉、山地鸡、禽蛋和鱼类、优质蔬菜、优质米、豆类等农产品市场价格不同程度上涨，品质优的粮经作物产品价格上涨幅度较大，但总量小；品质相对差的粮经作物产品价格持平或下跌。这给我们提出了必须加快优质粮经作物和特色农业发展的要求。2006年，全市农民人均纯收入虽然增长幅度比全省平均高4.5个百分点，但人均增加的绝对数却比全省平均低51元。

　　二是龙头企业的带动能力仍不强。临沧农业农村经济发展的最大“瓶颈”制约是农业产业化水平低，龙头企业带动能力弱。现有的龙头企业，大多数产品结构单一，深加工水平低，产业链不长，市场竞争能力弱，产业基地建设的标准化、规模化、规范化水平低。

　　三是农业综合生产能力弱。目前，我市农业农村经济发展中，粮食需求量稳步增加与人均耕地面积不断减少的矛盾越来越突出，农业基础设施建设滞后与抗灾保丰收的矛盾越来越突出，农业科技推广体系建设滞后和队伍弱化与农民渴望得到先进适用技术的矛盾越来越突出。这是关系农业农村经济可持续发展的重大问题，必须引起高度重视。

　　四是农业农村经济发展投入不足。由于我市财政较为困难，市、县（区）对农业产业特别是产业化基地建设、龙头企业发展的投入严重不足，优势特色农业资源开发程度低，特色农业产业发展慢。

　　五是农村基层组织在新农村建设中服务功能较弱。目前我市村级集体经济基本上都是“空壳”村，“无钱办事”的境况严重困扰着乡镇和村级干部，在新农村建设中，乡镇、村级无资金投入，靠上级支持资金又有限，从而严重制约着农业农村经济的大发展。