难溶盐(CaC03、CaSO4)沉淀：常用的防止难溶盐沉淀的方法有1)、软化法，通常采用石灰一苏打和离子交换树脂软化，钙离子、锶离子、钡离子，钠离子交换树脂软化，适用于小型苦咸水反渗透处理不适于海水，采用强阳离子交换树脂软化，钙离子、锶离子、钡离子除去率高于95％，可避免碳酸盐垢和硫酸盐垢。2)酸化法，加入硫酸或盐酸以降低进水的碱度使之达到pH5—6就可防止碳酸钙沉淀。3)添加阻垢剂，如羧酸聚合物类磷酸盐类、磺酸其盐类、聚丙烯酰胺类、混合剂阻垢剂。4)多元处理5)控制运转条件。

  有机物污染：天然水中的有机物大多来自土壤中的腐殖质、生活污水和工业废水。有挥发性低分子化合物如醇、酮、氨等，有极性阴离子型化合物如丹宁酸等，也有非极性弱离解的化合物如植物性蛋白等。它们呈悬浮、胶体、溶解三种形态存在于水中。对于不同的有机物种类应对应不同的去除方法，1)低分子易挥发有机物，可用脱气法除去；2)弱解离的大分子有机物可用吸附树脂除去；3)非极性、中高分子量的有机物可用活性炭吸附法去除；4)在某些情况下可用超滤和微滤去除有机物。由于可溶有机物与胶体不同，在天然水中处于真溶液状态的小分子有机物亲水性强，占有机物的主要部分，在水中虽呈负电性，但其为溶液状态，不可能被凝聚，所以用沉降或混凝法无法去除。而用活性炭吸附几乎可除去所有可溶性有机物且活性炭能可再生，但有些可溶有机物不能被潘 炭吸附如酚、醇等需要用氧化法处理，因此不同有机物应恰当选择合适的活性炭。用氯或NaCIO进行氧化，几乎能除去可溶性的、胶体状的和悬浮性有机物，现在应经有大量的水处理厂采用臭氧灭菌和除去有机物代替了可能产生致癌卤代物的加氯处理，使效果好，但成本相对较高。